Me he dado cuenta -después de mes y medio- que con la última actualización que realicé en Movable Type, las categorías que tenían acento o caracteres especiales nuestros (como la ñ) habían cambiado de nombre.
Así la categoría de fotografías Movable Type la llamó «cat_fotografas» pero con la nueva actualización parece que ya reconoce ese tipo de caracteres y cambio el nombre de la categoría a «cat_fotografias». Lo mismo con las demás.
Por tanto algunas categorías han estado todo este tiempo sin actualizarse ya que los tenía enlazado a las antiguas denominaciones. Ahora ya está corregido.